Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
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ZBED3Q96IU2 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
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ZBED3Q96IU2 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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