Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 SPIN2B-201ENST00000275988 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 BPIFA1-202ENST00000375413 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 MED15P8-201ENST00000411601 545 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AL023584.1-201ENST00000437067 349 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 LINC01839-201ENST00000451348 727 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 FAM74A6-203ENST00000615956 481 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 IL13-206ENST00000617259 498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 MIR6880-201ENST00000622851 62 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP263-201ENST00000363376 128 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP396-201ENST00000364834 120 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP55-201ENST00000364888 307 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms