Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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KNOP1Q1ED39 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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