Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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PTPROQ16827 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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