Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FXNQ16595 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FXNQ16595 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FXNQ16595 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FXNQ16595 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
FXNQ16595 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
FXNQ16595 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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FXNQ16595 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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FXNQ16595 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FXNQ16595 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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FXNQ16595 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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FXNQ16595 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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FXNQ16595 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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FXNQ16595 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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FXNQ16595 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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FXNQ16595 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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