Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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GRIK5Q16478 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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GRIK5Q16478 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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GRIK5Q16478 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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