Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA4Q16363 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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