Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms