Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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