Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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