Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms