Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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