Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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