Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms