| SEMA3A | Q14563 | C4orf33-204 | ENST00000502887 | 1126 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC008652.1-201 | ENST00000505261 | 469 nt | TSL 3 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC02496-201 | ENST00000509559 | 584 nt | TSL 3 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC034159.1-201 | ENST00000513885 | 583 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AP005357.1-201 | ENST00000520749 | 476 nt | TSL 3 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AF117829.1-202 | ENST00000524166 | 836 nt | TSL 3 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC105031.3-201 | ENST00000524359 | 616 nt | TSL 3 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | OR5AP1P-201 | ENST00000529730 | 940 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL354920.1-202 | ENST00000531661 | 1017 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MFAP5-212 | ENST00000543369 | 972 nt | TSL 3 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL160314.2-204 | ENST00000554730 | 380 nt | TSL 5 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL121579.1-201 | ENST00000555129 | 305 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC013565.1-201 | ENST00000565938 | 597 nt | TSL 2 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPL23AP87-202 | ENST00000573039 | 466 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC012417.1-201 | ENST00000582307 | 1039 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC015908.2-202 | ENST00000585243 | 756 nt | TSL 3 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ZNF788-206 | ENST00000596883 | 692 nt | TSL 3 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | IGHV3-29-201 | ENST00000604817 | 344 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL445567.2-201 | ENST00000618935 | 498 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL356321.1-201 | ENST00000621360 | 228 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR4727-201 | ENST00000622232 | 55 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC004009.2-201 | ENST00000623016 | 728 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | KIFAP3-202 | ENST00000367765 | 4111 nt | TSL 2 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PIGN-240 | ENST00000639912 | 6530 nt | TSL 5 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | TEX21P-201 | ENST00000447107 | 1476 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PCDH15-234 | ENST00000622048 | 6820 nt | TSL 5 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MGA-202 | ENST00000545763 | 11413 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SKIL-201 | ENST00000259119 | 3057 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MACF1-204 | ENST00000372915 | 23440 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | P2RY12-201 | ENST00000302632 | 1766 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC01902-202 | ENST00000636983 | 4607 nt | TSL 5 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RMDN2-204 | ENST00000406384 | 1932 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | THEMIS-205 | ENST00000626040 | 3179 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SLC30A6-203 | ENST00000379343 | 2354 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PTAR1-202 | ENST00000377200 | 9876 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-1042P-201 | ENST00000384204 | 107 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MT-TC-201 | ENST00000387405 | 66 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | FAR2P2-201 | ENST00000413041 | 594 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Z97055.1-201 | ENST00000419730 | 712 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL358472.1-201 | ENST00000431295 | 329 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MTND3P23-201 | ENST00000431980 | 347 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC093019.2-201 | ENST00000432294 | 384 nt | TSL 3 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC00280-201 | ENST00000439525 | 448 nt | TSL 2 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL136972.1-201 | ENST00000443471 | 351 nt | TSL 3 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | NUTM2A-AS1-209 | ENST00000447424 | 571 nt | TSL 3 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | TPT1P14-201 | ENST00000448018 | 505 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MYCBP2-AS1-202 | ENST00000448470 | 333 nt | TSL 3 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | OR6K1P-201 | ENST00000456766 | 971 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AMD1P1-201 | ENST00000457220 | 922 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNRPGP3-201 | ENST00000469405 | 227 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | NIPA2P2-201 | ENST00000496376 | 1083 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | FAM92A1P2-202 | ENST00000504766 | 877 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | HHIP-AS1-203 | ENST00000512359 | 646 nt | TSL 3 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC092542.1-201 | ENST00000513155 | 355 nt | TSL 2 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC097467.1-201 | ENST00000513660 | 370 nt | TSL 5 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC114781.4-201 | ENST00000513707 | 639 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-506P-201 | ENST00000516553 | 94 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU7-143P-201 | ENST00000516781 | 65 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC099805.1-203 | ENST00000518177 | 773 nt | TSL 2 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC109635.3-201 | ENST00000529536 | 185 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC118273.2-201 | ENST00000532092 | 465 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC091047.1-201 | ENST00000533344 | 552 nt | TSL 4 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL162872.1-201 | ENST00000557709 | 448 nt | TSL 3 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC092138.1-201 | ENST00000568659 | 472 nt | TSL 2 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | FOPNL-204 | ENST00000573396 | 735 nt | TSL 3 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR4284-201 | ENST00000578924 | 81 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR544B-201 | ENST00000582372 | 78 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | BNIP3P33-201 | ENST00000598912 | 569 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | IPO5P1-202 | ENST00000600039 | 287 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNRPGP15-201 | ENST00000600149 | 222 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | HMGN2P28-201 | ENST00000606102 | 262 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ADPRM-204 | ENST00000609540 | 1138 nt | TSL 5 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC00310-206 | ENST00000609947 | 892 nt | TSL 5 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC090970.3-201 | ENST00000612566 | 866 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CCL14-203 | ENST00000620991 | 426 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL445264.1-201 | ENST00000621719 | 171 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AP005264.7-201 | ENST00000625003 | 745 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL157396.1-201 | ENST00000630034 | 8444 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | N4BP2L2-202 | ENST00000357505 | 2917 nt | TSL 2 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MYOT-202 | ENST00000421631 | 1474 nt | TSL 2 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | NPFFR2-203 | ENST00000358749 | 1559 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC00907-209 | ENST00000593234 | 3376 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.76 | | |
| SEMA3A | Q14563 | TCP11X1-203 | ENST00000623912 | 1715 nt | TSL 5 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.76 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MTND5P26-201 | ENST00000426018 | 1752 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.76 | | |
| SEMA3A | Q14563 | TMEM71-202 | ENST00000377901 | 1861 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.76 | | |
| SEMA3A | Q14563 | UBE4A-201 | ENST00000252108 | 6103 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.76 | | |
| SEMA3A | Q14563 | GPRC6A-203 | ENST00000530250 | 2310 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.76 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MYCBP2-211 | ENST00000544440 | 14664 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Z82217.1-201 | ENST00000625157 | 8149 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL161781.1-201 | ENST00000354277 | 403 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SYF2-202 | ENST00000354361 | 926 nt | TSL 2 BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.813-201 | ENST00000364639 | 102 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RN7SKP226-201 | ENST00000364912 | 300 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU5E-5P-201 | ENST00000365379 | 116 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| SEMA3A | Q14563 | C6orf62-201 | ENST00000378102 | 741 nt | TSL 5 BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-328P-201 | ENST00000390887 | 106 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORD115-47-201 | ENST00000391226 | 86 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| SEMA3A | Q14563 | OR6C69P-201 | ENST00000394268 | 893 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RN7SKP56-201 | ENST00000410513 | 331 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC068295.1-201 | ENST00000413056 | 153 nt | TSL 3 BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |