Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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DDX39BQ13838 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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DDX39BQ13838 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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DDX39BQ13838 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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