Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms