Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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PRPF4BQ13523 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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PRPF4BQ13523 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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PRPF4BQ13523 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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PRPF4BQ13523 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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