Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRSQ13332 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRSQ13332 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms