Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SKP2Q13309 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms