Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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CBX3Q13185 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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CBX3Q13185 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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CBX3Q13185 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
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CBX3Q13185 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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CBX3Q13185 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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CBX3Q13185 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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