Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms