Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134 ms