Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PRDM2Q13029 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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