Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms