Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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CDH17Q12864 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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CDH17Q12864 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDH17Q12864 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CDH17Q12864 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CDH17Q12864 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CDH17Q12864 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH17Q12864 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH17Q12864 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH17Q12864 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH17Q12864 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH17Q12864 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH17Q12864 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH17Q12864 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH17Q12864 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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