Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.3 ms