Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
J3KRW8 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
J3KRW8 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms