Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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