Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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