Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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ATG3Q9NT62 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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