Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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FOXQ1Q9C009 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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FOXQ1Q9C009 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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FOXQ1Q9C009 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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FOXQ1Q9C009 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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FOXQ1Q9C009 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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