Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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