Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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