Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC3□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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C9orf40Q8IXQ3 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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C9orf40Q8IXQ3 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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C9orf40Q8IXQ3 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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C9orf40Q8IXQ3 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
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C9orf40Q8IXQ3 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf40Q8IXQ3 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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