Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FAM43BQ6ZT52 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FAM43BQ6ZT52 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms