Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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CCDC142Q17RM4 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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CCDC142Q17RM4 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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CCDC142Q17RM4 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
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CCDC142Q17RM4 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
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CCDC142Q17RM4 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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