Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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