Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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