Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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ZNF239Q16600 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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ZNF239Q16600 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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ZNF239Q16600 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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