Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
ZFHX3Q15911 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
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