Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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