Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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CCDC85BQ15834 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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CCDC85BQ15834 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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CCDC85BQ15834 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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CCDC85BQ15834 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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CCDC85BQ15834 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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CCDC85BQ15834 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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CCDC85BQ15834 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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CCDC85BQ15834 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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