Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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