Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.03□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms