Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
EEA1Q15075 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
EEA1Q15075 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
EEA1Q15075 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
EEA1Q15075 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
EEA1Q15075 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
EEA1Q15075 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
EEA1Q15075 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
EEA1Q15075 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
EEA1Q15075 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
EEA1Q15075 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
EEA1Q15075 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
EEA1Q15075 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
EEA1Q15075 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
EEA1Q15075 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
EEA1Q15075 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.9 ms