Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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