Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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SCARB2Q14108 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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