Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
COL4A6Q14031 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
COL4A6Q14031 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
COL4A6Q14031 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.05
COL4A6Q14031 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
COL4A6Q14031 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COL4A6Q14031 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COL4A6Q14031 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COL4A6Q14031 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
COL4A6Q14031 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
COL4A6Q14031 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COL4A6Q14031 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
COL4A6Q14031 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COL4A6Q14031 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
COL4A6Q14031 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
COL4A6Q14031 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
COL4A6Q14031 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
COL4A6Q14031 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COL4A6Q14031 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COL4A6Q14031 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COL4A6Q14031 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
COL4A6Q14031 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COL4A6Q14031 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
COL4A6Q14031 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COL4A6Q14031 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
COL4A6Q14031 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms