| RUNX2 | Q13950 | SEC23A-215 | ENST00000625395 | 261 nt | TSL 5 BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SPAM1-202 | ENST00000340011 | 2349 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LUM-201 | ENST00000266718 | 3008 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LGI1-210 | ENST00000629035 | 2251 nt | TSL 5 BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DAZ4-206 | ENST00000449750 | 3271 nt | TSL 5 BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KIF2A-205 | ENST00000506857 | 2219 nt | TSL 2 BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRMT10A-203 | ENST00000394877 | 3516 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PIGN-229 | ENST00000638936 | 4233 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ESCO1-201 | ENST00000269214 | 4523 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GPR18-203 | ENST00000397473 | 1660 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PARP15-206 | ENST00000493645 | 1311 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC004925.1-201 | ENST00000624256 | 2706 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC110597.3-202 | ENST00000583493 | 3289 nt | TSL 5 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR2M2-201 | ENST00000359682 | 1044 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-97P-201 | ENST00000363387 | 104 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP167-201 | ENST00000365461 | 116 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP283-201 | ENST00000365604 | 119 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRAV8-1-201 | ENST00000390430 | 473 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | USP9YP13-201 | ENST00000417797 | 480 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CR769775.2-201 | ENST00000417850 | 891 nt | TSL 3 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TOMM22P1-201 | ENST00000418578 | 312 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR1AA1P-201 | ENST00000419597 | 916 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL21P32-201 | ENST00000419877 | 477 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01794-201 | ENST00000420187 | 549 nt | TSL 4 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL117339.2-201 | ENST00000430475 | 180 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | USP9YP14-201 | ENST00000430663 | 563 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL353748.1-201 | ENST00000440753 | 474 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL162151.2-201 | ENST00000448875 | 158 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL513422.1-201 | ENST00000449531 | 383 nt | TSL 2 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC093110.1-201 | ENST00000456363 | 602 nt | TSL 2 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD42A-201 | ENST00000459584 | 64 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL132838.2-201 | ENST00000492041 | 314 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC146944.2-203 | ENST00000502493 | 354 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC093689.1-203 | ENST00000505967 | 299 nt | TSL 3 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02064-202 | ENST00000507876 | 403 nt | TSL 5 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC139495.1-202 | ENST00000513164 | 354 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010261.1-201 | ENST00000514411 | 457 nt | TSL 5 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ASPH-224 | ENST00000522603 | 842 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC022878.1-201 | ENST00000530684 | 149 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP003122.4-201 | ENST00000530980 | 758 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC091516.1-201 | ENST00000549191 | 703 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC073525.1-202 | ENST00000550049 | 732 nt | TSL 3 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01269-201 | ENST00000553682 | 602 nt | TSL 4 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL38-208 | ENST00000584577 | 344 nt | APPRIS ALT1 TSL 3 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC002546.2-201 | ENST00000585537 | 584 nt | TSL 3 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TPMTP1-201 | ENST00000592307 | 737 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC020910.2-201 | ENST00000603635 | 610 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC012557.2-201 | ENST00000605919 | 418 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC090425.2-201 | ENST00000608818 | 501 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MSANTD4-206 | ENST00000617528 | 508 nt | TSL 5 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC098679.4-201 | ENST00000624241 | 654 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC079597.1-201 | ENST00000624306 | 508 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC135584.1-201 | ENST00000624438 | 333 nt | TSL 5 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS4Y2-201 | ENST00000629237 | 792 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNF128-202 | ENST00000324342 | 2654 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | UBE4A-201 | ENST00000252108 | 6103 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00907-209 | ENST00000593234 | 3376 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TFPI-201 | ENST00000233156 | 3885 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BAZ2B-204 | ENST00000392783 | 8289 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | IFI16-208 | ENST00000448393 | 2245 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PTPN22-202 | ENST00000420377 | 2726 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF322-205 | ENST00000471278 | 2675 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BRCA2-201 | ENST00000380152 | 11986 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AK9-201 | ENST00000285397 | 2566 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CNOT2-231 | ENST00000551483 | 4753 nt | TSL 2 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TTC21B-AS1-201 | ENST00000440322 | 2260 nt | TSL 4 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SGO1-AS1-203 | ENST00000455626 | 2041 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | USP8P1-201 | ENST00000494673 | 3183 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNY4P24-201 | ENST00000362735 | 96 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP399-201 | ENST00000364003 | 117 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP189-201 | ENST00000364920 | 115 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | IVNS1ABP-201 | ENST00000367497 | 746 nt | TSL 5 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AKAP14-204 | ENST00000371431 | 977 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA3C-201 | ENST00000408792 | 125 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SKP56-201 | ENST00000410513 | 331 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL359704.1-201 | ENST00000411586 | 781 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092941.1-201 | ENST00000415940 | 427 nt | TSL 5 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCO3P12-201 | ENST00000416718 | 547 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL137856.1-202 | ENST00000418238 | 422 nt | TSL 3 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL691449.1-201 | ENST00000426570 | 421 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FTH1P6-201 | ENST00000430768 | 320 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL451129.1-201 | ENST00000437471 | 285 nt | TSL 3 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HSFY6P-201 | ENST00000445573 | 403 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | snoU13.24-201 | ENST00000458998 | 104 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL31P61-201 | ENST00000496160 | 376 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092994.1-201 | ENST00000498604 | 279 nt | TSL 3 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SAR1B-204 | ENST00000502539 | 708 nt | TSL 5 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SKP21-201 | ENST00000516503 | 220 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA31.20-201 | ENST00000517111 | 133 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | THEM7P-202 | ENST00000525689 | 764 nt | TSL 3 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MED28P5-201 | ENST00000528254 | 438 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CR383656.7-201 | ENST00000548164 | 174 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC073591.1-201 | ENST00000552736 | 597 nt | TSL 3 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MEG8-218 | ENST00000556720 | 456 nt | TSL 3 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC016987.2-201 | ENST00000560696 | 351 nt | TSL 3 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC087481.2-201 | ENST00000565492 | 330 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TMEM87A-212 | ENST00000568432 | 750 nt | TSL 3 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP001180.2-201 | ENST00000579413 | 422 nt | TSL 5 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF432-203 | ENST00000597273 | 624 nt | TSL 2 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC067959.1-201 | ENST00000604334 | 379 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |