Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX2Q13950 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.9 ms